干细胞为一种新型治疗，最适用干细胞移植病情。
1、糖尿病
干细胞移植治疗糖尿病已经成功应用到临床并且是最前沿的治疗技术，细胞治疗一方面可以对患者的胰岛功能进行恢复，另一方面可以对胰岛素抵抗进行调整，从而达到治疗的目的。治疗后不会产生任何并发症和副作用且可以提高身体免疫力、摆脱终身药物的治疗。此种技术的治疗效果是多种治疗法中最显著的。其中针对糖尿病并发症也能起到良好的治疗效果。
2.糖尿病足
糖尿病足是糖尿病的难治性继发疾病，患者在晚期往往面临着截趾、截足、截肢的悲惨结局。糖尿病患者足部溃疡多发生于罹患糖尿病10年后，病程超过20年者，糖尿病足的发生率可达到50％。而来源于骨髓或外周血的内皮祖细胞能够在血管损伤部位分化形成新生血管，进而改善肢体血供。87％的缺血肢体血供得到改善，踝肱指数增加，造影显示有明显的侧支血管生成，降低了截肢率，促使大部分溃疡愈合。更为重要的是，未出现任何并发症，临床安全性和有效性都得到初步肯定。
3、脑外伤后遗症
干细胞移植可以治疗脑外伤后遗症患者，是因为干细胞分化后产生神经元和胶质细胞可以分泌多种神经营养因子，改善脑局部微环境并启动再生相关因素顺序表达，使损伤轴突开始再生，它们同时产生多种细胞外基质，填充脑损伤遗留的空腔，为再生的轴突提供自持物；补充外伤后缺失的神经元和胶质细胞；使残存脱髓鞘的神经纤维和新生神经纤维形成新的髓鞘，保持神经纤维功能的完整性。再辅助系统的康复锻炼，促进移植的神经干细胞生长和修复作用，大大减少后遗症的发生或改善后遗症的状况，改善病人的生活质量。
4、脑瘫
神经干细胞移植后分化的神经元补充缺损的神经元，并促进小儿挠组织中的神经干细胞分化发挥功能，恢复脑神经的正常生长发育，改善大脑认知功能障碍，为脑性瘫痪小儿进一步康复提供了更多的机会，已为现今最有效的治疗方法。并且年龄越小，再构成代偿能力越强，治疗的可能性就越大。如果在神经干细胞移植以后接受规范系统的康复锻炼，将促进所移植神经干细胞的生长和发挥修复作用，效果将会更加理想。早干预、治疗是预防脑瘫致残的唯一途径。
5、脑出血
神经干细胞移植为脑血管后遗症的治疗开辟了一条新的途径，使患者的神经功能得以更好的恢复和改善。干细胞移植后分化成神经元以替代局部已受损的神经细胞，且能分泌多种神经营养因子和神经生长因子保护神经元还残存的功能，及时改善病变脑组织的功能，使患者的神经功能得以恢复和改善；在神经干细胞移植后继续接受规范系统的功能康复锻炼，治疗效果会更明显。
6、脑萎缩
目前因为脑萎缩的病因不清，慢性起病，早期诊断困难，药物治疗疗效无改善，随着干细胞技术的发展，干细胞已成为治疗萎缩的有效方法。
7、帕金森
移植的神经干细胞可以减少发生在帕金森症病人中的多巴胺能细胞的损害和替代此疾病中已经遗失的细胞。在移植患者的体内—脑皮质纹状体区、稳定、大量地定向分化为多巴胺能神经元，真正体现功能重建的治疗作用。
8、肝硬化（肝病）
随着近来组织工程的研究进展，干细胞治疗肝病已经成为最具前景的发展方向。成体干细胞中的间充质干细胞（MSC）因其低免疫原性，来源容易获得而成为目前用于干细胞治疗各种疾病的主要来源。
9、脊髓损伤
脊髓损伤后移植的神经干细胞能向损伤处迁移，且存活和增殖，分化为神经元或星形胶质细胞、少突胶质细胞，神经细胞轴突与髓鞘的再生，建立正确的和功能性的突触连接；并使残存脱髓鞘的神经纤维和新生的神经纤维形成新的髓鞘，保持神经纤维功能的完整性，恢复受损神经功能；再辅助以系统的康复锻炼，促进移植的神经干细胞生长和修复作用，大大的减少后遗症的发生和改善后遗症的状况，改善病人的生活质量。
10、恶性肿瘤
干细胞治疗恶性肿瘤有造血干细胞移植和间充质干细胞（MSC）移植。
1、造血干细胞移植：造血干细胞移植已成为根治恶性血液病（白血病、恶性淋巴瘤、多发性骨髓）、再生障碍性贫血、难治性免疫缺陷病、弄些遗传性疾病等45种疾病的有效手段。
2、间充质干细胞移植：是一种新的干细胞移植方法、 MSC是一种骨髓来源的具有多功能分化能力的细胞。通过采集自体。